มหาวิบัติ ดวงตาถล่มล้างโลก ภาค 1 ในปี 1969 เคนจิเด็กนักเรียนระดับประถมศึกษาและเพื่อนของเขาได้สร้างฐานลับในช่วงวันหยุดฤดูร้อน พวกเขาจินตนาการว่าพวกเขาต้องต่อสู้กับเหล่าวายร้ายที่ออกไปเพื่อพิชิตโลกและเขียนไว้ในหนังสือแห่งการพยากรณ์ หลายปีต่อมาในปี 1997 เคนจิ (โทชิอากิ คาราซาวะ) ถูกมองว่าเป็นเหล่าร้ายทำลายล้างโลก พวกเขาจึงต้องซ่อนตัวและรอคอยเวลาที่จะกลับมากู้โลก โอตโจะ (เอสึชิ โทโยคาวะ) พบว่าคันนะ (อาอิริ ทาอิระ) แยกตัวออกจากกลุ่มของโยชิสึเนะ (เทรุยูกิ คางาวะ) เพื่อตั้งกลุ่มต่อต้านของเธอเองขึ้นมาโดยรวบรวมกลุ่มคนที่หัวรุนแรง กว่าและพร้อมจะอุทิศตัวอย่างเต็มที่ ขณะเดียวกันก็มีชายลึกลับคนหนึ่งกำลังเคลื่อนไหวด้วยการบุกเข้าไปในเมืองโตเกียวเพื่อทำอะไรบางอย่างตามที่เขาตั้งใจไว้